فیلم "کاپیتان نوا" داستان یک ماموریت مخفی سفر به گذشته یعنی "نوا" به منظور تغییر مسیر وقایع در آینده است. در سال 2050، زمین به مکانی خشک و متروک تبدیل شده است. خلبان جنگنده نوا مجبور می شود برای جلوگیری از یک فاجعه ویرانگر محیطی در زمان سفر کند و به 20 سال قبل برگردد تا بتواند مقابل حرص و طمع یک شرکت بزرگ را بگیرد. این شرکت به تنهایی سیاره زمین را در سال های آینده ویران خواهد کرد.

در یک روستای کسل‌کننده که هیچ اتفاقی در آن نمی‌افتد، پسری یک مومیایی زنده را در اتاقش پیدا می‌کند. این شروع یک دوستی شگفت‌انگیز است.